В настоящее время органом управления Марусинского сельского поселения является администрация, она и осуществляет исполнительно- распорядительные функции в пределах своей компетенции, которые определяются Положением об администрации, утвержденным постановлением главы Марусинского сельского поселения.
Представительным органом сельского поселения, обладающим правом представлять интересы населения и принимать решения, является Совет депутатов.